BIO-RAD QX200™ Droplet Digital™ PCR System
QX200 Droplet Digital PCR (ddPCR™) sustav omogućava apsolutnu kvantifikaciju ciljnih DNA ili RNA molekula za EvaGreen ili na probama baziranim digitalnim PCR aplikacijama.
QX200™ Droplet Digital™ PCR sustav se sastoji od dva instrumenta, od QX200 droplet generatora i QX200 droplet čitača i od potrošnog materijala koji je dio sustava.
QX200 droplet generator se koristi da odijeli ddPCR reakcijsku mješavinu u tisuće dropleta nanolitarskih dimenzija. Nakon PCR reakcije u termalnom cycleru, dropleti iz svakog uzorka se individualno analiziraju na QX200 čitaču. Dropleti se čitaju jažicu po jažicu tako da dropleti jedan po jedan u seriji prolaze kraj dvobojnog optičkog detekcijskog sustava. U jednoj vožnji može biti obrađeno 96 uzoraka. Kako bi se dobila apsolutna kvantifikacija ciljne DNA broje se PCR pozitivni i PCR negativni dropleti, kao rezultat dobijemo broj kopija te broj kopija po 1µl (cpm). Amplificirani produkti se mogu po potrebi i ekstrahirati iz dropleta za potrebe PCR nizvodnih aplikacija kao što su sekvenciranje ili kloniranje. Operativni raspon detekcije ddPCR sustava je 0.24-5000 cpm/well.
Aplikacija QX200 Droplet Digital PCR (ddPCR™) sustava
Studije tumorskih bio markera i varijacija broja kopija (CNV)
Mjerenje različitih stupnjeva tumorskih mutacija, detekcija rijetkih kopija ciljne DNA, analiza varijacije broja kopija uz do sad neviđenu razlučivost i osjetljivost. Dostupni su i unaprijed osmišljeni te laboratorijski validirani testovi za detekciju mutacija i detekciju broja kopija.
Detekcija patogena
Zahvaljujući vrhunskoj preciznosti i razlučivosti QX200 sustav može kvantificirati male promjene količine ciljnih DNA ili RNA molekula u cilju detekcije i nadzora patogena .
Sekvenciranje slijedeće generacije (NGS)
Izvedite preciznu kvantifikaciju i kvalifikaciju NGS knjižnica bez upotrebe standardne krivulje.
Analize genske ekspresije
Postignite pouzdane i ponovljive rezultate malih promjena u količini malih količina mRNA i miRNA
Nadzor okoliša
Testirajte širok spektar okolišnih uzoraka kao što su tlo ili voda uz puno nižu razinu detekcije i puno veću rezoluciju nego do sada.
Testiranje hrane
Izvodite rutinski nadzor genetski modificiranih organizama (GMO) koristeći validirane ddPCR metode.
Dodatni instrumenti
QX200 droplet digitalni PCR sustav zahtjeva i upotrebu 96 deep well thermal cyclera kao što je npr. C1000 Touch™ Thermal Cycler with 96–Deep Well Reaction Module i PX1™ PCR Plate Sealer kako bi se osigurali da tijekom PCR reakcije ne bismo imali probleme sa isparavanjem uzoraka.
Potrebni dodatni materijali
DG8™ Cartridges – potrošni materijal koji se koristi u droplet generatoru kako bi se ddPCR mix odijelio u otprilike 20 tisuća nanolitarskih dropleta (točan volumen dropleta je 0.91nl).
DG8™ Gaskets – Potrošni materijal koji služi kao brtva za DG8 cartrige kako bi se prilikom generiranja dropleta stvorio pod tlak potreban za uspješno generiranje dropleta.
- Ulje za generiranje dropleta za probe
- Ulje za generiranje dropleta za EvaGreen
- Ulje za droplet reader
Specifikacije:
| Startna veličina uzorka, µl | 20 |
| kapacitet QX200 droplet generatora | 1-8 uzoraka/cartridge |
| Dropleta po 20 µl uzorku | 20000 |
| kapacitet QX200 droplet čitača | 1-96 uzoraka |
| Osvjetljenje uzorka | LED |
| Detekcija uzorka | Više-pikselni fotonski brojač |
| Detekcijski kanali | FAM (EvaGreen), HEX (VIC) |
| Linearni dinamički raspon | 5 redova veličine |
| Preciznost | ±10% |
| Dropleta po pločici sa 96 jažica, milioni | ~1.5 |
| Dimenzije QX200 droplet generatora (ŠxDxV) | 28 x 36 x 13 cm |
| Dimenzije QX200 droplet čitača (ŠxDxV) | 66 x 52 x 29 cm |
Više o BIO-RAD QX200™ Droplet Digital™ PCR System
